Задача увеличения числа параметров морского волнения, измеряемых радиолокационными методами, ставит вопрос калибровки новых алгоритмов обработки по данным контактных измерений. Для проведения спутниковых экспериментов предлагается использовать новый измерительный прибор — подводный акустический волнограф. Особенностью волнографа является возможность измерения именно тех характеристик волнения, которые влияют на отражение электромагнитных волн. В ходе теоретического анализа получены формулы для доплеровского спектра отражённого акустического сигнала в приближении метода Кирхгофа с учётом применения в приборе разных диаграмм направленности для приёмной и излучающей антенн. В результате был разработан алгоритм измерения всех статистических моментов волнения второго порядка модифицированным акустическим волнографом. С помощью нового алгоритма были обработаны данные, полученные в ходе численного эксперимента. Результаты обработки подтвердили работоспособность предлагаемого алгоритма, а также показали неэффективность ранее разработанного алгоритма при использовании новой конфигурации акустического волнографа.