Предложена схема нейтронного генератора на основе сильноточного ионного источника с нагревом плазмы на электронном циклотронном резонансе мощным миллиметровым излучением гиротронов. Наиболее перспективной областью применения такого нейтронного источника является медицина, а именно бор-нейтронозахватная терапия онкологических заболеваний. Рассмотрена возможность использования многоапертурных систем экстракции для формирования ионного пучка с целью повышения полного тока. Показано, что параметры вытекающего из ловушки потока плазмы позволяют эффективно применять многоапертурные системы без существенного проигрыша в плотности тока формируемого ионного пучка. Таким образом, использование многоапертурных систем в ионном источнике нейтронного генератора может позволить существенно увеличить полный нейтронный выход.