В работе исследовано влияние маскирующего фактора от локальных грозовых очагов на спектры УНЧ магнитных полей при существовании неоднородных структур электронной концентрации в локальной ионосфере (ионосферный и нижний ионосферный альвеновские резонаторы). На основе оригинальной методики обработки данных регистрации горизонтальных магнитных компонент на среднеширотном приёмном пункте «Новая Жизнь» исследован вклад источников, удалённых на различные расстояния от приёмного пункта, в формирование спектров фонового шума. Использовалась методика обработки УНЧ сигналов, позволяющая уменьшить импульсную составляющую магнитного шума выше некоторого порога по амплитуде и тем самым исключить влияние локальной грозовой активности. Анализируются также частотные зависимости азимутального угла главной оси эллипса поляризации магнитного шума. Показано, что наличие нижнего ионосферного альвеновского резонатора приводит к немонотонной зависимости азимутального угла от частоты. Обнаружено, что локальные грозы, находящиеся ближе $60{\div}80$ км от приёмного пункта, полностью маскируют проявление нижнего ионосферного альвеновского резонатора в поляризационных параметрах УНЧ шума. Для определения положения локальных грозовых очагов привлекались данные с метеорологического радиолокационного комплекса МРЛ-5, расположенного в Нижнем Новгороде.